Mało kto pamięta, że w 2001 roku zanim wróciliśmy na szczebel rozgrywek centralnych, tuż przed startem 2. ligi wzięliśmy udział w Pucharze Ligi. Przeciwnikiem Żółto-niebieskich była właśnie Jagiellonia, a pierwszy mecz zakończył się remisem (1-1). W rewanżu bramki nie padły i z awansu cieszył się białostocki klub, zaś w lidze lepsza okazała się Arka. Relacja z bezpośrednich starć z Jagiellonią z sezonu 2001/2002 przedstawia się następująco: "Kibice z Białegostoku, nie pojawili się na meczu Pucharu Ligi w Gdyni, za to tym razem na ligę przybyło ich 44 pociągiem, wraz ze swoją policją. Proponujemy im sparing, który miałby odbyć się po meczu. Na początku nie chcieli się zgodzić, po naszych namowach przystali po 10, po czym równo z gwizdkiem kończącym pierwszą połowę opuścili stadion i udali się w drogę powrotną. Podobno za sprawą swojej policji. Jak było naprawdę nie wiadomo. U nas znów kilka osób ze zgód. Pirotechniki tym razem nie było, bo myśleliśmy, że znowu nie przyjadą kibice Jagi." Później były już spotkania na zapleczu Ekstraklasy i baraż o pozostanie w niej, który zgromadził na trybunach ponad 11. tysięcy kibiców. Kilkukrotnie spotkaliśmy się również w najwyższej klasie rozgrywkowej - w tym raz na Narodowym Stadionie Rugby, na którym obecni byli fani Jagi. Była to ich ostatnia oficjalna wizyta w Gdyni, bowiem w ubiegłym sezonie sektor gości został zamknięty. Na dzień dzisiejszy nie posiadamy wszystkich liczb wyjazdowych kibiców z Białegostoku przy okazji meczów z Arki, ale przeglądając zdjęcia sprzed lat, widnieją na nich sympatycy BKS-u.

Data Mecz Sezon Gości
14.07.2001 Arka Gdynia - Jagiellonia Białystok (PL) 2001/2002 0
18.08.2001 Arka Gdynia - Jagiellonia Białystok 2001/2002 44
13.08.2003 Arka Gdynia - Jagiellonia Białystok 2003/2004 brak danych
11.06.2005 Arka Gdynia - Jagiellonia Białystok 2004/2005 brak danych
18.06.2006 Arka Gdynia - Jagiellonia Białystok (baraż) 2005/2006 brak danych
10.08.2008 Arka Gdynia - Jagiellonia Białystok 2008/2009 250
23.10.2009 Arka Gdynia - Jagiellonia Białystok 2009/2010 110
03.11.2009 Arka Gdynia - Jagiellonia Białystok (PP) 2009/2010 65
19.09.2010 Arka Gdynia - Jagiellonia Białystok 2010/2011 120
12.12.2016 Arka Gdynia - Jagiellonia Białystok 2016/2017 zamknięty sektor