W ujednoliconej z zasadami UEFA klasyfikacji Fair Play za sezon 2008/2009 Arka zajęła niewiele lepsze miejsce niż w rzeczywistej tabeli, bo dwunaste. Zwyciężył Lech Poznań, przed Piastem Gliwice oraz Wisłą Kraków.
Według, zgodnego z zasadami UEFA, regulaminu, punkty w klasyfikacji są przyznawane według 6 kryteriów: żółte i czerwone kartki, "gra pozytywna", zachowanie wobec przeciwników, zachowanie wobec sędziego, zachowanie osób na ławce rezerwowych oraz zachowanie publiczności. Za każde kryterium przydzielane są punkty, które składają się na końcową ocenę.
Klasyfikacja za sezon 2008/2009: 1. Lech Poznań - 8,045 2. Piast Gliwice - 7,837 3. Wisła Kraków – 7,739 4. GKS Bełchatów – 7,735 5. Polonia Warszawa – 7,715 6. Legia Warszawa – 7,625 7. Śląsk Wrocław – 7,573 8. Lechia Gdańsk – 7,490 9. ŁKS Łódź - 7446 10. Ruch Chorzów – 7,443 11. Polonia Bytom – 7,442 12. Arka Gdynia – 7,372 13. Jagiellonia Białystok – 7,352 14. Górnik Zabrze – 7,283 15. Odra Wodzisław – 7,138 16. Cracovia – 7,077
Źródło: własne/ekstraklasa.org